Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp12Q9D9M2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp12Q9D9M2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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