Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4bQ9D9F7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4bQ9D9F7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms