Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlirpQ9D8T7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlirpQ9D8T7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms