Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8N1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D8N1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8N1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8N1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D8N1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms