Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tnfrsf13cQ9D8D0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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