Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kctd4Q9D7X1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kctd4Q9D7X1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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