Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S7

Rpl22l1, 60S ribosomal protein L22-like 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl22l1Q9D7S7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rpl22l1Q9D7S7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl22l1Q9D7S7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl22l1Q9D7S7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rpl22l1Q9D7S7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms