Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q9D7E4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q9D7E4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Q9D7E4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q9D7E4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q9D7E4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q9D7E4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q9D7E4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q9D7E4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Q9D7E4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q9D7E4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms