Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Borcs8Q9D6Y4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Borcs8Q9D6Y4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms