Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc130Q9D516 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc130Q9D516 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms