Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D4W2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q9D4W2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D4W2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms