Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms