Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf3Q9D4H7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf3Q9D4H7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms