Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcc1Q9D4H2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gcc1Q9D4H2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms