Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam90a1bQ9D4F3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam90a1bQ9D4F3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms