Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sohlh2Q9D489 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sohlh2Q9D489 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sohlh2Q9D489 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms