Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Katnal2Q9D3R6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Katnal2Q9D3R6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms