Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy3Q9D394 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms