Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lamp5Q9D387 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms