Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx20Q9D2Y5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms