Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt44Q9D2Q2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trmt44Q9D2Q2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms