Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nol3Q9D1X0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms