Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab1bQ9D1G1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab1bQ9D1G1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms