Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem53Q9D0Z3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem53Q9D0Z3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms