Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snu13Q9D0T1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snu13Q9D0T1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms