Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Shisa9Q9CZN4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Shisa9Q9CZN4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shisa9Q9CZN4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Shisa9Q9CZN4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa9Q9CZN4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa9Q9CZN4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa9Q9CZN4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa9Q9CZN4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Shisa9Q9CZN4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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