Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Nde1Q9CZA6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nde1Q9CZA6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms