Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hdhd3Q9CYW4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms