Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube2fQ9CY34 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2fQ9CY34 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms