Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnih4Q9CX13 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnih4Q9CX13 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms