Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp23Q9CX11 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms