Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY3

Setd6, N-lysine methyltransferase SETD6, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd6Q9CWY3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Setd6Q9CWY3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd6Q9CWY3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms