Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rpusd4Q9CWX4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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