Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CWU4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CWU4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms