Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tdrd12Q9CWU0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tdrd12Q9CWU0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms