Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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