Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NubplQ9CWD8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms