Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms