Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lhfpl3Q9CTN8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lhfpl3Q9CTN8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms