Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp13a2Q9CTG6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp13a2Q9CTG6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms