Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrxn1Q9CS84 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrxn1Q9CS84 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms