Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpidQ9CR16 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpidQ9CR16 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpidQ9CR16 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms