Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms