Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg12Q9CQY1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg12Q9CQY1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms