Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ykt6Q9CQW1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ykt6Q9CQW1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms