Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rer1Q9CQU3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms