Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl35Q9CQL6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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