Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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