Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RTRAFQ9CQE8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms