Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc5Q9CQA1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc5Q9CQA1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms